Salah satu sarana yang juga sekaligus unit kerja di Yayasan Pesantren Islam (YPI) Al-Azhar adalah adanya klinik umum dan gigi. Pada struktur Yayasan, unit ini berada di bawah Bagian Sosial yang berperan dalam mengembangkan Islam melalui bidang kesehatan.

Pada dasarnya, klinik umum dan gigi dalah satu unit sosial yang melayani kebutuhan kesehatan ummat pada umumnya, dan warga Al-Azhar pada khususnya. Selama ini peran unit klinik sangat dirasakan menfaatnya dalam menjaga kesehatan jama'ah, khususnya warga Al-Azhar, sehingga mampu meningkatkan kinerja komunitas Al-Azhar dalam mencapai visi dan misi Yayasan. Dengan melibatkan tenaga medis yang handal dan berpengalaman, serta menekankan pada pelayanan yang Islami, diharapkan klinik umum dan gigi Al-Azhar akan semakin maju dan berkembang menggapai harapan ummat yaitu suatu saat nanti akan berdiri rumah sakit Al-Azhar yang terjangkau oleh semua kalangan.